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2.基因决定性状，转入的抗棉铃虫的基因与棉花纤维质量、皮棉占籽棉的比率没有任何关系。皮棉、纤维退化是正常的退化，常规棉花也会发生这种退化，原因在于棉花的天然异花授粉率在5%以上，所以容易退化，而小麦的天然异花授粉率在1%以下，所以不容易退化。所以小麦可以留种，而棉花不可以留种，必须年年提纯复壮，年年换种，否则就退化，不仅皮棉、纤维会退化，转基因也会退化，一切性状都会退化。
3.如果像蒋高明解释的那样，是“转入的基因干扰了棉花正常的生长发育”，那么头几年棉花纤维质量以及皮棉占籽棉的比率为什么不下降呢？
4.转基因抗虫棉不是一个独立的品种，是给现有的棉花品种转入抗虫的基因，全国约有几十个棉花品种被转入了抗虫基因，这几十个品种分布在全国各地，它们的抗虫性状以及各种性状是有差别的，某地好一些，某地差一些，很正常。但是全国转基因抗虫棉一直保持在几千万亩，这说明它在总体上是优越的。
蒋高明不懂农业，不懂转基因，却批判转基因，也被主流报纸和网民批判，他以《我对转基因的真实态度》回应：
第一，转基因技术一定要研究，如果应用，则需要时间来检验。
第二，粮食问题的真正原因，不是种子不争气，而是农民不愿意种地，另外，耕地质量因为长期使用化肥、农药、除草剂、地膜，出现了地力严重下降。
第三，转基因只能抗一种害虫，防治其他害虫依然要使用农药，而且长期种植转基因作物会引起生态环境的变化。
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